Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700066B19RikQ3TS39 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700066B19RikQ3TS39 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms