Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdnep1Q3TP92 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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