Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms