Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms