Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc10Q3TLI0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc10Q3TLI0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms