Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms