Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sppl2bQ3TD49 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sppl2bQ3TD49 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms