Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms