Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms