Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms