Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell1Q2VWQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nell1Q2VWQ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms