Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam178bQ24JP3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms