Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shroom4Q1W617 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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Shroom4Q1W617 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
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Shroom4Q1W617 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
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