Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ptchd1Q14B62 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ptchd1Q14B62 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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