Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf3ip1Q149C2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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