Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ttc39dQ0VF76 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms