Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp2b3Q0VF55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms