Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb8Q0VBD0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms