Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neurl1bQ0MW30 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neurl1bQ0MW30 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms