Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrioQ0KL02 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms