Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms