Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc21bQ0HA38 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms