Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Znf541Q0GGX2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf541Q0GGX2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms