Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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