Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms