Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SctQ08535 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SctQ08535 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SctQ08535 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SctQ08535 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SctQ08535 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SctQ08535 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SctQ08535 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SctQ08535 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SctQ08535 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms