Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col9a2Q07643 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms