Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
AmbpQ07456 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AmbpQ07456 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms