Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nfe2Q07279 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nfe2Q07279 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms