Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1bQ06985 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah1bQ06985 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms