Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox4Q06831 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms