Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms