Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Fmn1Q05860 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Fmn1Q05860 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fmn1Q05860 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms