Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms