Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox9Q04887 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms