Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smarcad1Q04692 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms