Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms