Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms