Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scg2Q03517 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms