Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tff2Q03404 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms