Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms