Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cacna1sQ02789 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms