Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb4Q02738 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms