Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms