Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd1Q02242 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd1Q02242 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms