Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ascl1Q02067 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms