Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uba1Q02053 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms