Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mc1rQ01727 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms