Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms