Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HmgcrQ01237 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms